膿包性毛囊炎的治療包括局部用藥、口服抗生素、抗真菌藥物。一旦確診膿包性毛囊炎，應及時就醫，嚴格遵醫囑用藥治療。
1、局部用藥：患者可以在醫生的指導下使用夫西地酸乳膏、莫匹羅星軟膏、魚石脂軟膏等。夫西地酸乳膏對引起毛囊炎的金黃色葡萄球菌等有較好的抗菌活性；莫匹羅星軟膏能有效抑制細菌蛋白質合成；魚石脂軟膏可促進膿包成熟、破潰，有利于膿液排出，減輕炎癥反應。
2、口服抗生素：對于癥狀較重、多發或伴有發熱等全身癥狀的患者，應遵醫囑口服抗生素，如頭孢克洛膠囊、阿莫西林膠囊、羅紅霉素膠囊等。這些藥物能通過抑制細菌細胞壁合成或影響細菌蛋白質合成等機制，廣泛殺滅引起毛囊炎的致病菌，控制感染擴散。
3、抗真菌藥物：若膿包性毛囊炎是由真菌感染引起，如馬拉色菌毛囊炎，則需要使用抗真菌藥物，患者可在醫生指導下使用酮康唑乳膏、硝酸咪康唑乳膏、鹽酸特比萘芬乳膏等。這些藥物可破壞真菌細胞膜結構或抑制其合成，從而消除真菌，緩解癥狀。
在治療期間，要注意保持皮膚清潔，避免搔抓、擠壓膿包，防止炎癥擴散和遺留瘢痕。飲食上宜清淡，避免食用辛辣、油膩、甜食及刺激性食物，如辣椒、油炸食品、蛋糕、咖啡等，多吃蔬菜水果，保持大便通暢。保證充足睡眠，避免熬夜。