芬太尼是強效阿片類止痛劑，屬于麻醉鎮痛類藥物，需由正規醫院的專科醫生根據患者病情進行使用，屬于管制藥物，在應用過程中應嚴格監測生命體征的變化。芬太尼可能會出現心血管系統、呼吸系統、神經系統、胃腸道系統、過敏等方面的副作用。
1、心血管系統：應用芬太尼以后可出現心動過緩，也可以出現低血壓的情況，大劑量應用芬太尼還可發生高血壓、心動過速的表現，嚴重者還可引起心臟停搏、心血管抑制的情況；
2、呼吸系統：應用芬太尼較常見的是呼吸系統副作用，可出現呼吸抑制、缺氧甚至窒息等表現，應用芬太尼時應給予吸氧，并嚴格監測生命體征；
3、神經系統：應用芬太尼后可引起典型的阿片樣中樞神經系統效應，包括過度鎮靜、眩暈、疲勞、頭暈等，大劑量應用芬太尼后還可出現語言障礙、激動不安等表現，易產生藥物依賴，且有一定成癮性的副作用；
4、胃腸道系統：表現為阿片類藥物的副作用，如惡心、嘔吐、腹瀉等，通常在停藥后可緩解此癥狀；
5、過敏：如皮疹、瘙癢或注射部位產生燒灼感等，嚴重的過敏反應也可出現休克的情況。
芬太尼功效較多，但造成的副作用也較多，患者使用時建議聽從醫囑，由專科醫生根據患者的病情選擇劑量。若存在腎功能不全，使用該藥物后出現腎毒性反應，應及時停用藥物，以免加重癥狀。