耳朵疼但是檢查沒問題，可能是長期熬夜、咽炎、偏頭痛等原因引起的，建議及時就醫進行治療。具體分析如下：
1、長期熬夜：如果患者長期熬夜，就會導致耳部神經損傷，就容易引起耳部疼痛的癥狀。建議保持作息規律，避免熬夜，還可以遵醫囑吃烏靈膠囊、安神補腦液等藥物來緩解。
2、咽炎：當患者患有咽炎，出現疼痛的癥狀后，疼痛可能會蔓延至耳部神經，進而出現耳部疼痛的癥狀，可以遵醫囑使用青霉素V鉀片、雙氯芬酸鈉腸溶片、琥乙紅霉素片等藥物進行治療。
3、偏頭痛：當患者出現偏頭痛后，整個一側的神經都會受到影響，所以耳部的神經也會受到影響，且頭痛的時候還會導致耳部也伴隨疼痛。所以建議遵醫囑使用苯甲酸利扎曲普坦片、佐米曲普坦片等藥物進行治療。
此外，還可能是植物神經紊亂、三叉神經痛、腦出血等原因引起的，建議及時就醫進行治療。