尖銳濕疣HPV病毒多久轉陰沒有統一的說法，且治療尖銳濕疣目前沒有有效藥物，無法依靠系統應用抗病毒藥物根除HPV感染。一般6個月左右可以達到臨床治愈效果，也就是沒有癥狀，但尖銳濕疣HPV病毒有可能會一直攜帶，多久轉陰并不能確定。
雖然外科、局部用藥及物理等療法可以去除肉眼可見的疣體，但不能殺死HPV病毒，當機械刺激、損傷、免疫抑制、炎癥及其他細胞外因素，觸發潛伏在宮頸基底細胞中的HPV病毒時，可能使其再次繁殖出現疣體復發。臨床也有使用系統性抗病毒藥物治療的方法，但也僅僅是使病毒量低于參考下限而不是完全轉陰，因此從這個角度講并不存在尖銳濕疣HPV病毒轉陰的說法。