病毒或細菌感染引起的胃腸炎在臨床癥狀方面一般沒有明顯的區別，所以患者通常不可通過癥狀的方式來區分病因。若患者感染后出現惡心、嘔吐、腹痛、腹瀉、發熱等癥狀，建議患者盡快前往醫院就診。臨床一般通過實驗室相關檢查，如血常規、便常規、病原學檢查等方式來辨別病毒和細菌胃腸炎。

1、血常規：

根據外周血白細胞總數、中性粒細胞數、嗜酸性粒細胞數等初步判斷感染的類型，明確是細菌感染、病毒感染，還是寄生蟲感染。其中，中性粒細胞增多常見于細菌感染，淋巴細胞和單核細胞增多見于病毒感染。嗜酸性粒細胞增多常見于寄生蟲感染。

2、便常規：

病毒性急性胃腸炎患者的糞便外觀多為黃色水樣，無膿細胞和紅細胞。不同細菌感染后糞便可呈不同性狀，如稀水樣便、膿血便、水樣便、黏液便、血便等。

3、病原學檢查：

通過該項檢查可以檢出微生物的具體種類，一般屬于確診證據，但目前培養陽性率較低。

此外，患者還可采用血清抗體檢測來明確診斷。確診后建議患者在醫生的指導下使用腸炎寧片、蒙脫石散等藥物來治療。平時應重視飲食衛生，不吃沒有烹飪熟的食物。