尿道灌注可以用來改善尿道炎癥狀，尿道灌注是將藥物灌注到炎癥的部位，可以起到消炎的治療效果。但尿道灌注也有一定的損傷，因為做尿道灌注需要插導尿管，可能會損傷到尿道黏膜，因此女性經尿道進行灌注，多數會有不適癥狀，一般有輕微的疼痛，但屬于可接受的范圍，相對于男性而言，女性尿道相對比較平、直、短、寬，對尿管的置入反應性比較小，因此女性尿道灌注時，比男性尿道灌注的疼痛感或者不適感輕，女性進行尿道灌注時，可能由于使用的藥物不同，疼痛的程度也存在差異，尿道灌注的藥物可以分為細胞毒類藥物、免疫抑制劑。
1、細胞毒類藥物：在細胞毒類的化療藥物當中，常用的包括吡柔比星、表柔比星、羥基喜樹堿等藥物，但易引起化學性的膀胱炎和血尿，而出現化學性膀胱炎的時候，患者可能會出現尿頻、尿急、尿痛的癥狀，停止灌注后可自然緩解；
2、免疫抑制劑：目前主要選擇卡介苗，卡介苗是滅活的結核分枝桿菌，可激發膀胱的局部免疫反應，從而達到治療膀胱癌的目的，但易引起膀胱的刺激癥狀、血尿癥狀和全身的流感樣癥狀，少見的副作用還包括結核性敗血癥等。由于免疫抑制劑誘發的免疫反應類似于結核性膀胱炎的表現，有明顯的尿頻、尿急、尿痛，因此疼痛癥狀可能比較重。
尿道灌注主要是將藥物稀釋后，通過尿道口注射進入尿道，常見的是膀胱腫瘤灌注化療，也可以經尿道口留置導尿管，通過導尿管將藥物注射入膀胱內，通過改變不同的體位進行膀胱腫瘤的化療，對預防膀胱腫瘤復發具有一定效果。另外，尿道灌注可以使細菌逆行進入體內，引起炎癥，也容易引起尿道感染和尿道損傷，因此通常不建議經常進行尿道灌注。