腸胃炎一般指胃腸炎，胃腸炎頭疼可能是發熱、植物神經紊亂、胃腸黏膜急性損傷等原因引起的，需要積極配合醫生進行治療。
1、發熱：部分胃腸炎的患者在疾病發作期會出現發熱的癥狀，可能會刺激腦部血管擴張，從而引起頭疼的癥狀，患者可以遵醫囑服用布洛芬緩釋膠囊、對乙酰氨基酚片等退熱的藥物進行治療。
2、植物神經紊亂：如果患者存在胃腸炎的情況，可能會影響患者的正常休息，從而造成植物神經紊亂，出現頭痛、頭暈、乏力等癥狀，患者可以遵醫囑服用谷維素片、甲鈷胺膠囊等營養神經的藥物進行治療。
3、胃腸黏膜急性損傷：如果患者胃腸炎的病情比較嚴重，就可能會引起胃腸黏膜急性損傷，引起電解質紊亂的情況，導致患者出現嘔吐、頭疼、意識喪失等癥狀，患者可以遵醫囑使用葡萄糖氯化鈉注射液、補液鹽等補液的藥物進行治療。
出現胃腸炎頭疼的癥狀，建議患者及時去醫院就診，通過體格檢查、血常規、實驗室檢查、核磁共振成像、胃腸鏡等方式來明確病情的發展，然后積極進行對癥治療。在治療期間患者需要注意保持清淡飲食，多喝水促進代謝，有利于病情的恢復。