龜頭炎脫皮，可能存在真菌感染，也可能存在細菌感染，可以提取局部的分泌物，進行分泌物涂片培養確診。之后可在醫生指導下及時進行治療，以控制真菌感染或細菌感染。在治療期間應當加強日常護理，避免性生活，保持局部清潔干燥，清淡飲食，并且避免食用刺激性食物，忌煙酒，合理休息。
1、真菌感染：比如本身存在腳氣，而且內褲與襪子同時進行清洗，就可導致龜頭上出現真菌感染，引起真菌性龜頭炎。由于炎性物質刺激，就會引起局部脫皮，可能還伴有明顯瘙癢以及刺痛，確診后可外用克霉唑軟膏、硝酸咪康唑乳膏等藥物治療。當感染特別嚴重時，需使用口服藥物治療，例如伊曲康唑膠囊、氟康唑片等；
2、細菌感染：若男性本身存在包皮過長、不經常更換內褲，也不對包皮內部進行清洗等情況，容易使包皮內部細菌滋生，誘發細菌性龜頭炎。這時由于炎癥刺激，也可導致龜頭脫皮，還會伴有紅斑、刺痛的改變，嚴重時可導致糜爛、滲出，確診后可外用紅霉素軟膏、夫西地酸乳膏等藥物給予治療。嚴重時需口服左氧氟沙星片、阿莫西林膠囊等藥物配合治療。
龜頭炎脫皮還可能是真菌和細菌混合感染，一般會同時存在瘙癢、刺痛、糜爛等表現，需要聯合使用抗真菌和抗細菌的藥物進行治療。