厭氧菌感染引起的牙疼，遵醫囑吃甲硝唑片或者是膠囊都是可以的；如果牙疼為非厭氧菌感染引起，此時吃甲硝唑片或者是膠囊，通常不能起到治療的效果。
甲硝唑的相關劑型有片劑、緩釋片、栓劑、含片、膠囊、口頰片等。甲硝唑的硝基進入人體后，可被還原生成一種具有抗厭氧菌作用的代謝物，可以抑制厭氧菌的脫氧核苷酸合成，達到抑菌、抗菌、殺菌的效果。如果牙疼是厭氧菌感染引起的，此時可以遵醫囑吃甲硝唑片或者是膠囊，也可以遵醫囑選擇緩釋片、口頰片等劑型，具體的劑型需在醫生指導下選擇。除治療厭氧菌感染引起的牙疼外，還可治療厭氧菌感染造成的中耳炎、滴蟲性陰道炎、闌尾炎、膽囊炎、骨髓炎、腹膜炎、心肌壞死等疾病。
需要注意，導致牙疼的原因較多，除厭氧菌感染外，還可能是顳下頜關節疾病、甲狀腺炎、偏頭痛、叢集性頭痛，心絞痛、急性心肌梗死等情況誘發的，需要針對原發疾病進行治療，一般不使用甲硝唑類藥物進行治療。
治療期間要注意口腔衛生，養成飯后漱口，早起睡前刷牙的好習慣。