通常情況下，蓮子不去芯能吃。蓮子的芯即蓮子心也是一味中藥材，所以不僅蓮子肉可以吃，蓮子心也能吃，也具有一定的藥物功效。作為中藥食用時，患者還應在中醫師指導下合理食用，避免盲目自行用藥而影響身體健康。
蓮子味甘、澀，性平，歸脾、腎、心經，具有固精止帶、補脾止瀉、益腎養心等功效，臨床適用于脾虛泄瀉、帶下、腎虛遺精、滑精、遺尿、尿頻等病癥。蓮子心味苦，性寒，歸心、腎經，具有清心安神、交通心腎、澀精止血等功效，臨床上可用于治療熱入心包、神昏譫語、心腎不交、失眠遺精、血熱吐血等病癥。吃蓮子的同時加上蓮子心，可以在一定程度上增強藥效，如補脾益腎、清心安神等作用，而且臨床暫時沒有權威數據表明兩者存在配伍禁忌和毒副作用，因此可以同時食用。
但由于蓮子心偏寒性，因此在食用時一定要控制好攝入量，并且脾胃虛寒者不宜用，以免進一步損傷脾胃而加重原有病情。此外，由于每位患者的體質、病情等不同，具體藥物用量也會存在個體化差異，患者應嚴格遵醫囑使用蓮子和蓮子心。