肺炎不一定要肺灌洗。當肺炎病原菌診斷不明或治療效果不佳時，可考慮肺灌洗。因為通過支氣管肺泡灌洗，可以獲得更準確的肺部病因信息，病因鑒定和相關藥敏試驗有助于下一步的診斷和治療。
重癥肺炎在經驗性抗感染治療后仍在進展，此時，通過支氣管肺泡灌洗，進行相關病原體分析，有助于準確的抗感染治療。還有比如在懷疑結核病時，通過肺灌洗、相關病原學檢測和耐藥性分析，也有助于下一步的診斷和治療。因此，肺灌洗是在肺炎病原體診斷不明確或治療效果不佳時可以考慮的方法。
肺灌洗可分為支氣管肺泡灌洗和肺灌洗。支氣管肺泡灌洗一般針對呼吸系統疾病的診斷。
肺灌洗主要用于肺部吸入粉塵、硅肺（早期）和肺泡蛋白沉積癥患者。
肺灌洗可以清除肺泡內的沉積物和炎性分泌物，改善呼吸系統的呼吸功能，對肺部疾病的治療和預防起到很好的作用。