清洗包皮垢疼可能是過度用力、毛囊炎、龜頭炎等原因導致的，男性通常應對癥治療。
1.過度用力：男性平時在清洗包皮時，如果用力過度，可能因為包皮受到摩擦，進而導致疼痛。建議男性將包皮上翻清洗時注意力度，不要過于用力。
2.毛囊炎：男性的包皮可能被細菌、真菌等病原體感染引起毛囊感染，進而出現紅色丘疹等情況，還可能會伴隨出現紅腫、熱痛等情況。包皮垢在清洗的過程中，可能會刺激皮損，進而加重疼痛感。男性可以按照醫囑使用莫匹羅星軟膏、復方酮康唑乳膏、克霉唑乳膏等藥物進行治療，通常可以起到抗感染、抗菌等作用。
3.龜頭炎：龜頭炎是各種因素引起的龜頭或包皮的炎癥。男性的包皮和龜頭可能會出現紅腫、疼痛等情況，男性清洗包皮垢時，可能碰觸到患處，進而導致疼痛。男性可以按照醫囑使用氟尿嘧啶軟膏、咪喹莫特乳膏、紅霉素軟膏等藥物進行治療，一般可以起到抗感染、消炎等作用。
該現象除了可能是上述原因造成的之外，還可能與其他因素有關，比如外傷、生殖器皰疹、尖銳濕疣、梅毒等，需及時治療。