起床口臭可能是食物殘渣殘留、扁桃體結石、牙周炎等原因相關，可在前往耳鼻喉科、口腔科等科室就診后，通過實際情況采取具體措施進行改善。
1、食物殘渣殘留：若患者在睡覺前沒有及時有效清潔口腔，存在食物殘渣殘留的情況，便可能在睡覺時因口腔中的細菌分解食物殘渣的過程中產生異味，進而導致起床口臭，屬于正常的生理現象，一般在患者睡前通過正確的方式刷牙后，避免口腔內有食物殘渣殘留，就有助于改善起床口臭的現象。
2、扁桃體結石：慢性炎癥刺激、長期吸煙都可能誘發扁桃體結石，一般在扁桃體結石體積較小時，可能沒有明顯癥狀，但隨著扁桃體結石體積逐漸增大，便可能表現為咽痛、咽癢、口臭等，所以該疾病也可能引起起床口臭，建議患者平時注意保持飲食清淡，避免扁桃體受到刺激，還可在醫生指導下使用刮匙或鉗子，或采取扁桃體切除術取出。
3、牙周炎：該疾病屬于一種慢性感染性疾病，可能和牙菌斑、精神壓力過大等因素相關，患者可能表現為牙齦鮮紅、牙齦水腫等，在睡覺后因牙菌斑上附著的較多細菌在口腔內持續不斷滋生，便容易產生口腔異味，進而容易造成起床口臭，患者可在醫生指導下使用醋酸氯己定溶液、甲硝唑片、阿莫西林膠囊等藥物進行改善，較為嚴重時還可通過牙周翻瓣術、軟組織移植術等方法進行手術治療。
慢性胃炎等也可能造成起床口臭，可根據實際原因采取相應措施改善。