月經剛干凈體溫升高了可能是激素變化、盆腔炎、甲狀腺功能亢進癥等原因造成的，建議及時到醫院進行治療。
1、激素變化：月經剛干凈時，體內孕酮的分泌可能會逐漸增多，激素的變化就可能會導致體溫出現輕微上升的情況，一般不用做特殊處理。
2、盆腔炎：如果女性在月經期間沒有做好護理，受到病原體的感染，就可能會誘發盆腔炎，導致患者出現體溫升高的現象，患者可以在醫生的指導下使用克林霉素片、甲硝唑片等藥物來控制感染，使體溫逐漸恢復正常。
3、甲狀腺功能亢進癥：該病是甲狀腺激素過多引起機體代謝亢進的內分泌疾病，也會導致患者在月經剛干凈時出現體溫升高的現象，建議遵醫囑使用鹽酸普萘洛爾片、卡比馬唑片等藥物進行治療，能夠下調β受體，從而達到治療的效果。
此外，患者出現上述癥狀也可能是肺炎、肺結核、肝硬化等原因造成的，建議及時到醫院就診。