每天刷牙牙齒還有黑漬可能是牙漬、牙菌斑、齲齒等導致的。原因不同，處理不同。
1.牙漬：
食用過多含色素的食物以及飲料，如糖漿、中藥等會導致牙齒黑，不容易清潔，造成食物殘渣附著在牙齒上，就算天天刷牙牙齒也還是會有黑色物質。長期用氯己定或高錳酸鉀溶液漱口或用藥物牙膏，長期接觸某些礦物質等因素會在牙面附著色素，刷牙難以除去。
可到口腔科進行洗牙，其中的噴砂可以去除大多數外源色素，恢復牙齒本來的顏色。
2.牙菌斑：
可能是因為牙齒上有牙菌斑，牙菌斑大多是因為沒有養成良好的口腔衛生習慣，導致口腔中殘留的食物在細菌作用下發酵并共同附著在牙齒表面所形成，如果不及時去除的話就會慢慢發展成為齲齒。
刷牙是清除牙菌斑最主要的方法。有牙菌斑刷牙時尤其要注意牙齒和牙齦交匯處，這里最容易附著牙菌斑，另外使用含氟牙膏更好，因為氟有抑制牙菌斑的效果。牙線也能有效地清除牙齒鄰面的牙菌斑，預防牙周疾病和鄰面齲。
3.齲齒：
齲齒是由細菌感染造成的牙齒脫礦，呈現白堊色，后因色素沉著在牙齒脫礦的部位呈現出黑色。早期齲未形成齲洞者、即將在1年內被恒牙替換的乳牙、靜止性齲病等。
齲齒治療的常用藥物包括氨硝酸銀和氟化鈉等。手術治療有銀汞合金充填術，對已形成實質性缺損的牙齒，充填術是目前應用最廣泛且成效較好的方法，適用于充填后牙和隱蔽部位的前牙洞。復合樹脂充填術，適用于充填前牙和不承受咀嚼力量的后牙洞。酸蝕法光敏復合樹脂充填術，適應于充填前牙和不承受咀嚼力量的后牙洞。還適用于牙體缺損較多、固位較差和遮蓋變色牙等。
每天刷牙牙齒還有黑漬，建議及時就診明確病因，在醫生指導下針對性治療。