支原體感染后，吃了三天阿奇霉素還咳嗽，可能與服藥時間過短、合并其他疾病等因素有關，需對癥治療。具體分析如下：
1.服藥時間過短：患者在吃阿奇霉素后，藥物在患者體內形成有效的血藥濃度通常需要一定的時間，如果服藥時間過短，可能治療效果不明顯，所以支原體感染后，吃了三天阿奇霉素還咳嗽可能與服藥時間過短有關。患者需堅持服藥，還可以在醫生的指導下服用止咳藥物進行治療，如肺力咳合劑、復方甘草片、蘇黃止咳膠囊等。
2.合并其他疾病：阿奇霉素主要用于治療感染性疾病，對非感染性疾病無效，如果患者在支原體感染的同時還合并有其他非感染性疾病，如咳嗽變異性哮喘、胃食管反流病等，可能會出現支原體感染后，吃了三天阿奇霉素還咳嗽的情況。咳嗽變異性哮喘患者可以在醫生的指導下使用環索奈德氣霧劑、沙丁胺醇吸入氣霧劑、丙酸氟替卡松吸入氣霧劑等藥物進行治療；胃食管反流病患者可以在醫生的指導下使用奧美拉唑腸溶膠囊、蘭索拉唑腸溶片、泮托拉唑鈉腸溶片等藥物進行治療。