菊花菜又稱為菊花腦、菊花葉，是較為常見的藥食同源兩用植物。其副作用較多，包括加重腹瀉、加重痛經、加重經期疼痛等。
1、加重腹瀉：菊花菜為菊科植物，本身即具有瀉肝火，促排便的作用，且其性較寒涼，寒性凝滯，而吃寒涼之品可能會傷脾出現泄瀉，所以如果患者在腹瀉時，服用菊花菜，則可能會導致腹瀉癥狀加重；
2、加重腹痛：脾主運化，轉輸精微，胃主降濁，受納腐熟水谷。二者相互配合，則水谷受納與運化才能協調，完成水谷的消化過程。當患者飲食不節，貪涼傷陽，則使脾陽為寒所遏，中焦虛寒，升清降濁功能失常，脾胃運化功能失職。此種情況下再服用寒涼性質的菊花菜，會導致脾胃再受到傷害，其功能下降，患者會出現胃寒隱痛癥狀；
3、加重經期疼痛：痛經的誘因中以感受寒涼者居多，且寒凝血瘀型痛經在所有患者中所占的比例最高。菊花菜屬于較寒涼食物，如患者在月經來潮期間食用菊花菜，則可能導致寒凝胞宮，氣血運行受阻，使得痛經癥狀更加嚴重。
另外，還有少部分人吃菊花菜之后，會出現泛吐清水、手足不溫等不適癥狀。建議菊花菜在醫生的指導下，根據自身情況食用，以免影響健康。