IgA腎病IEE三級有30%的概率會發展為終末期腎病，引發尿毒癥，所以不是全部患者均會發展為尿毒癥。如果患者有發展為尿毒癥的趨勢，應及時前往醫院進行藥物治療或手術治療。
IgA腎病IEE三級病情通常不嚴重，在鏡下通常僅可見輕至中度彌漫性系膜細胞增殖和系膜基質增寬，有時可能會見到小新月體和球囊粘連。這種疾病預后差異很大，多數患者腎功能可長期維持正常，但如果患者發病年齡大，在治療過程中會出現大量蛋白尿，或有血壓升高，又或腎活檢時發現血管硬化或新月體形成等，這類患者預后較差，通常有30%左右的人群可最終因為腎功能衰竭而發生尿毒癥，但大部分人群并不會發生。
如果患者有發展為腎功能失代償的情況，需積極進行藥物干預，如降壓、利尿等，同時要糾正酸中毒、促進毒素排泄，還要積極糾正貧血、代謝紊亂。通常按照醫生建議進行規范治療，可良好控制患者疾病發展情況，有助于提高預后。如果藥物治療效果不好，腎功能失代償，可能會發展為尿毒癥，建議進行透析或腎臟移植治療，可幫助提高患者的存活概率，并提高生活質量。
患者在日常生活中也需要調整飲食、保持良好心態，促進病情好轉，并遵醫囑規范復查。藥物的使用需要嚴格遵醫囑進行，不可以隨意濫用，因為多數藥物需要經過肝腎進行代謝，濫用后可能會導致腎臟損傷加重。