通常來講，囊胚著床時沒有什么感覺，但每個人的反應可能存在差別，可能部分女性會產生瞬間的刺痛感。如果女性出現瞬間刺痛感，是否是由于囊胚著床導致的不能完全確定，建議及時去醫院進行相關檢查。
囊胚著床屬于較復雜的過程，在移植的過程中，首先囊胚需要黏附子宮內膜，其次鉆入子宮內膜內，才能完成著床的過程。囊胚植入時女性可能沒有什么感覺，也可能由于子宮進行擴張，使局部組織出現瞬間的刺痛感，或伴有少量出血、下腹墜脹感等癥狀。但出現以上癥狀，并不意味著一定與囊胚著床直接相關，可能是在操作過程中所致的瞬間的刺痛感，而且也不是每位女性都可以感受到，所以臨床無法單純通過瞬間的刺痛感來判斷囊胚是否著床。
女性在囊胚著床期應該放松心情，避免過度關注腹部感覺，并且適當休息，避免劇烈運動或者進行性生活。建議在月經延遲10天左右或者囊胚移植后，前往醫院進行血液HCG檢測，進一步確定是否懷孕。