液氮冷凍的疼痛在Ⅵ-Ⅶ級以下，但是具有一定的個體差異性，需要根據實際情況具體分析。
液氮冷凍是指通過極速的冷凍殺死病毒的方法，屬于冷凍生物學的綜合效應，正常細胞在極度冷凍的狀態下，會發生不可逆轉的損害，從而達到治療疾病的目的，在臨床上常用于治療尖銳濕疣、雞眼等皮膚病。正常情況下液氮冷凍疼痛等級在Ⅵ-Ⅶ級以下，但是具有差異性。
液氮冷凍治療會疼痛，主要是由于病灶局部的神經末梢以及周圍正常組織容易被凍到，部分患者還可能會出現水泡的情況。疼痛程度是由冷凍部位和時間所決定的，但大部分患者都可以忍受，一般不需要使用麻醉藥。疼痛劇烈的時候可以遵醫囑口服布洛芬緩釋膠囊、對乙酰氨基酚片等藥物止痛，以免疼痛影響正常的工作和生活。
在用冷凍治療頭皮、額、顳部等部位的損害時，有可能還會導致偏頭痛樣的頭痛，可以持續1-2個小時。如果患者疼痛癥狀一直不能緩解，應及時就醫，通過視診、血常規等方式明確病因，對癥處理，平時還要注意避免患處沾水，積極復查。