琥珀安神丸和朱砂安神丸均具有養心安神的作用，都可用于治療心血不足、心悸失眠等癥狀。但二者在多個方面也有一定區別，如藥物性狀、藥物組成、功效主治、注意事項等方面。二者均為處方藥，需遵醫囑用藥。
1、藥物性狀：琥珀安神丸為棕褐色的大蜜丸，味甘、微酸、辛。而朱砂安神丸為棕紅色的大蜜丸，味苦、微甜；
2、藥物組成：琥珀安神丸由地黃、當歸、柏子仁、酸棗仁、天冬、麥冬、五味子、大棗、人參、茯苓、丹參、遠志、玄參、甘草、南蛇藤果、桔梗、琥珀、龍骨等組成。而朱砂安神丸由黃連、甘草、熟地黃、地黃、當歸、黃芪、酸棗仁、龍齒、茯苓、柏子仁、遠志、朱砂等組成；
3、功效主治：琥珀安神丸具有滋陰養血、補心安神的作用，主要用于治療心血不足、心悸失眠、虛煩不安等。朱砂安神丸具有養血益氣、鎮驚安神的作用，主要用于治療心血不足引起的心煩體倦、怔忡健忘、少眠多夢、心神不定等；
4、注意事項：琥珀安神丸外感發熱患者忌服，且不宜同時服用藜蘆、五靈脂、皂莢及其制劑。服藥期間不宜喝茶和吃蘿卜，以免影響藥力。朱砂安神丸中含有毒性中藥朱砂，不宜與海藻、昆布等含碘豐富的中藥配伍，以免發生中毒，也不宜與鎮靜催眠藥、麻醉藥同用，以免加重中樞抑制。