玄米茶是以糙米為原料制成的一種飲品，具有很高的營養價值，一般長期適量喝玄米茶對健康人群來說，不會對機體帶來危害，反而能夠起到一定的寧心安神、利咽清熱的功效。但是如果長期大量喝玄米茶，可能會引起上火，這是因為玄米茶屬于熱性，其中的糙米多需要熱火炒熟，長期大量喝可能會導致口腔潰瘍、口干舌燥等上火癥狀，尤其是對于肝火旺盛的人群來說，長期大量喝玄米茶會加重肝火，進而對身體造成一定的損傷。因此，對于虛火旺盛和肝火旺盛的人群來說，盡量不要長期喝玄米茶。
另外就現代營養學的角度來看，玄米茶使用的糙米含有一定膳食纖維，因而具有促進胃腸蠕動、潤腸通便的作用，對于腹瀉人群來說，也不建議喝，可能會加重病情。除此之外，茶類中的茶多酚、咖啡因等具有提神醒腦的功效，長期大量喝很可能會影響睡眠，特別是對于有睡眠障礙的人來說，睡前喝玄米茶可能會加重失眠癥狀。