根管治療第三次特別疼，可能是根尖孔受刺激、殘髓炎、根尖周炎導致的，建議及時告知醫生，在醫生指導下使用藥物緩解、完善根管治療來改善。
1、根尖孔受刺激：如果在采取根管治療時，如果根管器械超出了根尖孔，可能會對根尖造成刺激，引起疼痛，這多數是因為操作不當導致的。建議盡量選擇正規公立醫院，考察醫生資質，減少治療時出現風險的概率。
2、殘髓炎：如果在根管治療過程中，因為有一部分牙髓沒有去干凈，或殘留在牙齦中的牙根沒有取出，可能會引起殘髓炎，出現自發性疼痛。建議患者及時告知醫生，通過局部注射麻藥來減輕疼痛。
3、根尖周炎：如果根管治療后沒有將藥物沖洗干凈，因為牙髓腔為封閉組織，藥物造成刺激后可能會引起根尖周炎，出現叩痛、咬合疼等不適癥狀。建議及時就醫打開牙髓腔，采取完善的根管治療，還可以遵醫囑使用布洛芬緩釋膠囊、醋酸地塞米松片等藥物緩解。
建議患者在日常注意口腔清潔，定期清理牙齒，少吃堅硬、黏糯的食物，如果牙齒發生病變，盡量及時采取完善的治療，避免引起不適癥狀。