女性慢性腸炎在臨床上不存在最佳的治療方法，女性慢性腸炎的治療方法有一般療法、服用藥物和靜脈點滴，效果較好。
1.一般療法：如果慢性腸炎的癥狀較輕，患者可以多喝一些溫開水，補充身體所需的水分，還需要多休息，每天的睡眠時間達到6~8個小時左右，對促進病情恢復有幫助。
2.服用藥物：慢性腸炎可能是細菌感染導致的，也可能是不良的飲食習慣引起的，可在醫生的指導下服用頭孢氨芐膠囊、青霉素V鉀片等藥物進行治療。
3.靜脈點滴：慢性腸炎以維持水電解質平衡為主，針對病情嚴重的患者，需要及時靜脈點滴糾正水電解質平衡紊亂，醫生可以使用緩沖生理鹽水、葡萄糖注射液等藥物進行治療。
患病期間避免進食辛辣刺激的食物，可在醫生指導下多吃富含蛋白質的食物，比如雞蛋、瘦肉等。在日常生活中要少食多餐，盡量選擇進食細軟、溫熱，容易消化的食物。