結核性腦膜炎一般住院3個月左右，不過是否需要延長住院時間，或者是否能出院，還應根據患者病情治愈程度確定。結核性腦膜炎，一般采取以抗結核藥物治療為主的綜合治療，結核性腦膜炎的治療原則是早期、聯合、規律、適量、全程用藥。只要患者臨床癥狀、體征、實驗室檢查等均提示為結核性腦膜炎，應立即開始抗結核治療。
1、初次治療住院患者：臨床上認為，結核性腦膜炎的治療療程為12-18個月，強化期治療一般在3個月以內，結核性腦膜炎一般聯合使用2種，或2種以上的抗結核藥物。在強化期治療用藥較多，可能會因為聯合用藥出現一些毒副作用，應當密切觀察病情的變化，所以強化期的治療一般需要住院治療，因此結核性腦膜炎的住院治療，應當在3個月左右。如果患者需要延長強化期治療的時間，住院期間也可能會相對延長；
2、復治患者：根據患者既往用藥史和藥物敏感試驗，治療應選擇敏感藥物。一般與初次住院時的住院時間類似，不同的是聯合使用藥物會增加，治療時間一般在18個月以上。