肺部感染多重耐藥菌能治好，且并非所有多重耐藥菌都需要治療，需要根據患者痰液或支氣管抽吸物培養和藥敏試驗結果，并結合臨床癥狀等因素，明確該多重耐藥菌是否為致病菌，根據藥敏試驗結果，在醫生指導下選擇敏感的抗生素治療，并加強痰液引流等。
發現多重耐藥菌，需要排查是否為致病菌。如果患者痰液等培養出多重耐藥菌，但沒有發熱、咳嗽、咳痰及白細胞、炎癥因子增高等感染的表現，提示該病菌只是與患者呈現相同寄生關系，為定植菌。這種情況，不需進行特殊的抗感染治療，可在醫生指導下適當輔助排痰，促進痰液引流。
如果痰或支氣管抽吸物培養為多重耐藥菌，患者同時有咳嗽、咳痰，血常規異常、炎癥指標增高和肺CT滲出性感染灶，提示可能為導致肺部感染的致病菌，需及時調整治療，反復留取痰或支氣管抽吸物送檢，動態觀察痰培養變化。不同多重耐藥菌耐藥譜存在差異和變化，需根據藥敏試驗結果，選擇敏感的抗生素，同時要結合患者感染部位，選擇相應的血藥濃度分布高、抗感染療效好的藥物，一般可以治好。