如果感冒進展到后期仍然不停咳嗽，可以服用對癥治療的藥物，如鎮咳藥。另外，更為重要的是需要明確引起感冒的原因，服用對因治療的藥物，如對于常見的細菌感染，可以服用抗生素類藥物。此外，臨床針對咳嗽癥狀，常用表面激素霧化吸入治療，根據病情急、慢性以及不同病因，有多種藥物及方式可供選擇。
1、對癥治療藥物：常用鎮咳藥可分為中樞性鎮咳藥和外周性鎮咳藥，中樞性鎮咳藥有右美沙芬、噴托維林等，外周性鎮咳藥有那可丁、苯丙哌林等。也可以使用中成藥制劑治療，如感冒止咳糖漿，對于感冒后期不停咳嗽均存在一定的緩解作用；
2、對因治療藥物：感冒以病毒和細菌感染較為常見，病毒感染常為自限性疾病，患者服用上述鎮咳藥控制癥狀即可，也可考慮在醫生指導下應用阿昔洛韋等抗病毒藥物。如果是細菌感染，則需針對性使用抗生素，如金黃色葡萄球菌感染時，可以使用頭孢呋辛等。若為肺炎鏈球菌感染，可以使用青霉素、左氧氟沙星等。如果治療效果較差，還可考慮進行藥敏試驗，從而選擇較為敏感的抗生素，以取得較好的療效，使感冒后期不停咳嗽的癥狀得到緩解。
但需注意，藥物的具體使用，還是應到醫院完善相關檢查后，確定感染的病原體，在醫生的指導下進行用藥，以免隨意使用鎮咳藥等而產生依賴性。此外，不停咳嗽不一定是感冒的原因，可能是哮喘及其他病因引起，此時需通過血氣分析、支氣管激發試驗等明確診斷，而針對相應疾病，比如對于哮喘，可應用沙丁胺醇霧化吸入等進行治療。