藍桉通常沒有毒。
藍桉是一種中藥材，主要是藍桉的葉和果實可以入藥，味微辛、微苦，性平，主要具有疏風解熱、抑菌消炎、防腐止癢的功效，內服時可以用于治療流行性感冒、上呼吸道感染、咽喉炎、支氣管炎、肺炎、腸炎等疾病，外用時可以治療燒燙傷、皮膚濕疹、足癬等疾病，還可以用于皮膚消毒。患者出現上述疾病時，可以在醫生的指導下適量使用藍桉，一般不會對人體造成損害，是沒有毒性的。
但是，部分人群可能會對藍桉和其中的某些物質過敏，使用后可能會出現過敏反應，如皮膚瘙癢、皮疹、疼痛、紅腫等癥狀。而且嬰幼兒的免疫力比較低，使用藍桉還有可能對神經系統產生影響，影響嬰幼兒的正常生長發育，所以一般不建議過敏者和嬰幼兒使用藍桉，以免對人體造成損害，不利于身體健康。
建議用藥期間還應注意保持飲食清淡，要合理安排飲食，不要暴飲暴食，盡量少吃辛辣、油膩的食物，可以適當吃新鮮的蔬菜和水果，如白菜、菠菜、獼猴桃、橙子等，有利于增強體質，促進身體恢復。