頭皮上長小紅疙瘩很痛可能是毛囊炎、脂溢性皮炎、頭癬等原因造成的，建議及時遵醫囑使用藥物治療。
1.毛囊炎：細菌、真菌、病毒等的感染都可能會誘發毛囊炎，當毛囊發生炎癥，就可能會導致患者頭皮部位出現丘疹疙瘩，一般伴有疼痛，建議患者遵醫囑使用莫匹羅星軟膏、夫西地酸乳膏等藥物進行治療。
2.脂溢性皮炎：該病的發生與遺傳、心理因素有關，由于病原體的刺激，就可能會導致患者頭皮部位出現鱗屑、疙瘩，一般伴有疼痛，建議及時遵醫囑使用復方地塞米松乳膏、醋酸地塞米松乳膏等藥物進行治療。
3.頭癬：頭癬是頭皮和毛發受到皮膚癬菌感染所引起的傳染性疾病，由于皮膚癬菌的刺激，就可能會導致患者頭皮部位出現疙瘩和疼痛，建議及時遵醫囑使用克霉唑乳膏、酮康唑乳膏等藥物進行治療。
此外，患者出現上述癥狀也可能是濕疹造成的，建議及時到醫院就診。