根管治療后仍有膿包，通常不會自愈。仍有膿包的原因可能是治療不徹底和感染兩方面，需要到醫院進行口腔檢查，以確定原因，然后在醫生指導下進行對癥治療。
一、治療不徹底：1、未完成根管治療：根管治療通常需要做1-4次不等，第1次治療需清除病變的牙髓組織等病原刺激物，并且進行消炎處理。第2次治療需進行患處沖洗及消炎，若還存在炎癥，則需要進行第3次治療。一般在第1次治療過后仍有膿包，屬于正常現象，需要繼續接受治療；
2、牙髓殘留：由于根管系統解剖復雜，難以將牙髓完全清除。殘留牙髓如果受到細菌、器械或藥物刺激，可發生炎癥反應，導致患牙出現叩擊痛、咬合痛及牙齦膿包等癥狀。這種情況下需在局部麻醉下將殘髓拔除，重者需予以抗生素治療，待癥狀消失后完成根管充填。
二、感染：1、微生物感染：主要由根管內殘留的微生物感染引起，這種情況需要接受根管再治療，嚴重者需通過外科手術才可治愈；
2、異物反應：根管填充使用的牙膠和糊劑、口腔內異物等，都可能引起感染，繼而出現膿包。建議根管治療后注意口腔衛生，避免口腔異物引發感染的情況。對于牙膠和糊劑引發的感染，則需接受根管再治療進行去除。
