通常情況下，跑步時肚子疼可能是運動不當、飲食過多、胃腸炎等原因引起的，建議患者根據不同的原因選擇不同的治療方式，具體情況分析如下：
1.運動不當：患者在跑步之前，準備活動不夠或未做準備活動，劇烈活動時肌肉進入緊張狀態，而內臟器官惰性大，不能馬上活動起來，以滿足肌肉活動時所需要的養料和氧氣，使呼吸肌緊張而痙攣，從而導致跑步時肚子疼?；颊呖梢酝ㄟ^按摩的方式來緩解不適。
2.飲食過多：患者在跑步前，吃了過多的食物，劇烈運動導致消化不良，出現跑步時肚子疼的情況。一般情況下，患者可以在醫生的指導下使用乳酸菌素片、雙歧桿菌活菌散、健胃消食片等藥物來調理。
3.胃腸炎：胃腸炎是各種原因引起的胃腸黏膜炎癥的總稱，常見的癥狀有腹痛、腹瀉、腹脹等，可能會導致跑步時肚子疼。一般情況下，患者可以在醫生的指導下使用硫酸阿托品片、阿莫西林膠囊、消旋山莨菪堿片等藥物來治療。