射精后腎痛腰疼痛可能是腎虛和腎炎的原因，也有可能是腎結石所造成。
1.腎虛：男性性生活過度、長期抽煙、喝酒等不良的生活方式會引起腎陽虛，性興奮時間較長會導致背部的肌肉出現緊張情況，從而產生腰部疼痛，長期過度性生活會產生射精疼痛，可以通過服用左歸丸等中成藥物來調理。
2.腎炎：患有慢性腎炎在過性生活的時候會導致腎透支，從而產生腰痛和腎痛的癥狀，有可能還會伴隨著肢體水腫，腎臟代謝異常會導致尿液無法排出，出現水腫的癥狀，可以遵醫囑服用腎炎靈顆粒、尿毒清顆粒等藥物來進行治療。
3.腎結石：結石在體內受到移動和摩擦會對腎臟產生刺激感，主要的癥狀也是腎痛和腰痛，應該采取用體外碎石的方法來進行治療，能夠幫助結石排出。
射精后腎痛腰疼痛可以到醫院做泌尿系統和腎臟檢查，具體的治療方式可以根據醫生的診斷和疾病原因來治療，同時也要改正不良的生活方式，應該忌煙酒避免過度性生活。