科興新冠疫苗為新型冠狀病毒滅活疫苗，與其他種類的疫苗副作用類似。常見副作用包括接種部位的癥狀、發熱癥狀、呼吸道癥狀、消化道癥狀，以及過敏反應等。
1、接種部位的癥狀：接種科興新型冠狀病毒疫苗后可能會引起接種部位的疼痛、紅腫、硬結等不適，上述副作用一般情況下能夠耐受，可逐漸得到恢復；
2、發熱癥狀：科興新型冠狀病毒疫苗的常見副作用之一為發熱，臨床中多數情況下表現為低熱，而且通常是一過性的，可較快得到緩解；
3、呼吸道癥狀：如可能會出現咳嗽、咽痛等副作用，與急性呼吸道感染可能有一定相似性，需要注意鑒別；
4、消化道癥狀：如惡心、食欲不振等，如果進食辛辣、油膩食物后，就有可能會加重以上癥狀；
5、過敏反應：科興新型冠狀病毒疫苗屬于異體蛋白質，可能會成為過敏原誘發過敏反應。輕者可能僅出現皮疹、皮膚瘙癢癥狀，但嚴重過敏反應則可能會引起胸悶、呼吸困難、休克等癥狀，多在接種疫苗后短時間內出現。因此，接種疫苗后一般需要在接種點觀察半小時以上，明確自身是否出現不適。