蟲草花燉瘦肉的禁忌有嬰幼兒、兒童，以及對真菌過敏者不宜食用，陽盛者不宜過多食用，而且食用蟲草花燉瘦肉時不建議攝入冷飲、豆類，以免影響身體健康或降低藥效。
蟲草花又稱蟲草菌、北冬蟲草，是一味壯陽藥。蟲草花味甘，性平，歸肺、腎經。瘦肉則是指豬、牛等家禽的瘦肉部分。由于蟲草花燉瘦肉中的蟲草花是壯陽藥，因此不適合嬰幼兒、兒童等人群食用。此外，蟲草花并不是花，而是人工培養的蟲草子實體，屬于一種真菌類，因此對真菌過敏者不可使用，以免出現皮膚瘙癢等過敏作用。
另外，蟲草花燉瘦肉的食用者可能為陽虛體質的人群，此時不建議同時飲用冷飲，以免加重陽虛的情況，并影響蟲草花的藥效。豆類也可能會與瘦肉中的鈣等礦物質結合，從而影響瘦肉的營養價值，因此不建議蟲草花燉瘦肉和豆類食物一起大量食用。此外，在急性咳嗽、炎癥、感冒的期間，盡量不要食用蟲草花燉瘦肉，以免加重病情。
對于腦力勞動者、亞健康人群、易疲勞者、易感冒者、過肥過瘦者、體弱者、免疫力低下者，以及面部有色斑或晦暗者、年老體弱者、病后體衰者、產后體虛者等人群，比較適合食用蟲草花燉瘦肉。但由于蟲草花為中藥材，因此食用前建議到正規醫院的中醫內科就診，完善望、聞、問、切等檢查，然后遵醫囑正確食用。