一般情況下，足底按摩痛一般與過度勞累、臟腑病變等因素有關。
在過度勞累的情況下，如久站、久行、劇烈運動、負重勞損之后，足部會產生疲憊的現象，此時進行足底按摩會感到疼痛，這是因為足底按摩的力度一般較大，刺激到足底筋膜后產生的正常反應，一般不需要過多擔心。
中醫認為，腳底包含了各經絡、各臟腑區域，因此，在做腳底按摩時感到疼痛，可能是存在有關臟腑經絡不通、郁結或虧虛的情況。不過，按壓后的疼痛，并不一定會反映出臟腑的病變，這是因為每個人對疼痛的感知有差異，即使感覺到疼痛，也不一定是出現了臟腑病變。
另外，中醫認為，足底按摩可以改善全身五臟六腑的功能，比如緩解失眠、圍絕經期綜合征等。對于一些慢性疾病，如心律不齊、冠狀動脈粥樣硬化性心臟病、腦血栓、中風等疾病有很好的緩解作用。對肺部出現的慢性支氣管炎、阻塞性肺氣腫等疾病，也 可以通過足底按摩進行治療。主要的作用是通過升高腳部的溫度，促進體內的血液循環，從而帶動全身的新陳代謝。
注意足底按摩的力度不宜過大，容易造成疼痛等不適反應。