舌頭根兩側有紅色凸起疙瘩，可能是口腔潰瘍、過敏、舌炎等原因引起的，建議患者通過藥物的方式進行治療。
1、口腔潰瘍：口腔潰瘍是指出現在口腔內唇、上顎以及舌頰等部位黏膜上，呈圓形或橢圓形的疼痛潰瘍點，可導致舌頭根部兩邊都有紅色疙瘩凸起。建議患者在醫生的指導下使用曲安奈德口腔軟膏、醋酸地塞米松口腔貼片等藥物進行治療。
2、過敏：如果患者進食了容易過敏的食物，例如魷魚、海蝦、海蟹等，過敏物質很有可能會刺激舌頭，引起炎癥，表現為舌頭根部兩邊都有紅色疙瘩凸起，還伴有口腔瘙癢、吞咽困難等不適癥狀。建議患者在醫生的指導下使用馬來酸氯苯那敏片、依巴斯汀片等藥物進行治療。
3、舌炎：微量元素缺乏、局部刺激、感染等因素可能會誘發舌炎，導致患者出現舌頭腫痛、舌乳頭改變、顏色改變等癥狀，還伴有上述癥狀。建議患者在醫生的指導下使用甲硝唑芬布芬膠囊、維生素B2片等藥物進行治療。
此外，上述情況還有可能是干燥綜合征、手足口病、舌頭腫瘤等原因引起的，需要盡快就醫診治。同時避免過度緊張、勞累、失眠，養成良好的睡眠習慣。盡量減少刺激性食物的攝入，比如酸、燙、辣等。戒煙酒，不要挑食、偏食。