早上起來牙疼，過一會兒就好，可能是刷牙的水溫過低等非病理性因素引起的，也可能是牙周炎、慢性牙齦炎、齲齒等病理性因素引起的，需要根據實際情況處理。
一、非病理性因素
牙齒、牙齦經過一晚上沒有接觸食物，也沒有咀嚼動作，可能相對敏感，若天氣寒冷，患者刷牙的水溫過低，導致牙齦的敏感性增加，容易出現一過性牙疼的情況。建議用溫水刷牙、漱口，多吃小米粥、面條等清淡的食物。
二、病理性因素
1、牙周炎：該病是牙周組織的炎癥，可能導致牙齦受刺激，伴有牙齦紅腫、牙菌斑以及牙結石等癥狀，輕度疼痛的患者較多，所以早上醒來后可能會消失。患者可遵醫囑口服人工牛黃甲硝唑膠囊、洛索洛芬鈉片等藥物治療，止痛的效果一般比較好。
2、慢性牙齦炎：該病的典型癥狀為牙齦色澤改變、組織水腫、疼痛等，長期的炎癥刺激可能會引起口臭、牙疼等，早上還不適應進食、喝水、刷牙等外界刺激，可能會導致癥狀暫時加重。患者可以遵醫囑使用過氧化氫溶液、氯己定含漱液等藥物治療，從而促進炎癥消失。
3、齲齒：常因牙齒日常護理不當導致，牙齒多數會出現褐色、黑色的齲洞，對冷、甜的刺激敏感，部分患者可在早晨伴有一過性疼痛的癥狀。建議患者遵醫囑用氟化鈉甘油糊劑、氟化亞錫溶液等藥物治療，能夠幫助牙齒恢復硬度，必要時采用補牙的方式進行填充。
此外，口腔潰瘍、根尖周炎、牙神經受損、牙髓炎等也可能導致該癥狀。如果不適感嚴重，患者應該及時就醫，通過血常規、口腔頜面部檢查、口腔X光片檢查等方式檢查，明確病因，積極對癥治療。平時的飲食宜清淡，加強口腔清潔。