乳桿菌活菌膠囊通常指陰道用乳桿菌活菌膠囊。乳酸菌陰道膠囊和陰道用乳桿菌活菌膠囊的使用方法及適應證通常一樣，但是其主要成分和作用不一樣。
1、使用方法及適應證一樣：乳桿菌活菌膠囊和陰道用乳桿菌活菌膠囊，都可以用于治療由菌群紊亂而引起的陰道疾病。
2、主要成分和作用不一樣：乳酸菌陰道膠囊的主要成分為活腸鏈球菌，陰道用乳桿菌活菌膠囊的主要成分為乳桿菌活菌。前者的作用是分解糖類，補充乳酸，提高陰道酸度。后者的作用是直接補充陰道內正常生理細菌，調節陰道內菌群平衡，抑制并消除陰道中的有害細菌。
出現上述疾病的患者，可遵醫囑選擇其中一種治療即可。兩種藥物的使用方法都為陰道內給藥，治療期間要定期清洗外陰，保持局部干凈衛生。