治療肛乳頭瘤可用電灼療法：使用安全適度的電流去掉病變組織，再以火花放電灼除殘存病損，操作時需要注意不要損傷到其他正常組織。中醫治療：對早期疾病采用一些預防性的治療，對不能手術的患者，在治療的同時，可以配合中藥灌腸治療，以提高療效。