冷凍、激光等治療手背起扁平疣需要先查皮膚CT，如果皮膚CT能夠證實是扁平疣，就可以進行如下治療。
一般可以使用液氮冷凍，二氧化碳激光燒灼，以及藥物等方法進行治療，藥物可以外用咪喹莫特乳膏，維a酸乳膏交替涂擦。另外還可以全身用藥。在生活當中也應當注意，不要過度的情緒激動，不要吃熱性的食物，多吃蔬菜水果。