根據你的描述，可能存在以下幾種情況：
首先，39歲女性出現月經不調和乳房脹痛可能是內分泌失調引起的，尤其是雌激素水平過高可能導致這些問題。
其次，乳房的疙瘩可能與乳腺增生或纖維化有關，這些情況在更年期前后尤為常見。
建議你進行以下檢查：
激素水平檢測：包括雌激素、雄激素等，以明確內分泌狀態
甲狀腺功能檢查：甲狀腺問題也可能導致月經不調和體重變化
乳腺超聲或鉬靶檢查：評估乳房結節的性質
腎上腺功能評估：長期雌激素過高可能與腎上腺分泌有關
針對治療，可以考慮以下方案：
調整生活方式：保持規律作息、均衡飲食、適度運動
中醫調理結合西藥：如溴隱亭等藥物調節內分泌
如果有明顯不適，可能需要手術干預
定期隨訪激素水平和乳腺情況
建議到正規醫院的婦科或內分泌科就診，并在醫生指導下制定個性化治療方案。