判斷卵巢囊腫是良性腫瘤還是惡性腫瘤，主要依據以下幾個方面：第一、卵巢囊腫要根據腫物的大小判斷，囊性是否伴有出血、壞死，囊內容物是漿液性還是黏液性。一般惡性腫瘤會出現實性腫物，多彩狀，伴有出血壞死等。第二、卵巢囊腫需要經過手術切除來進行病理檢查，并根據組織細胞結構的特點來診斷，必要時應該結合免疫組織化學染色和基因檢測從而進行有針對性的治療。