亞急性甲狀腺炎病程長短不一，可自數星期至半年以上，一般為2-3個月，故稱為亞急性甲狀腺炎。
亞急性甲狀腺炎在發病初期會表現為低熱，還會伴有寒戰、發抖、厭食、食欲減退、乏力等癥狀，這種癥狀通常不會持久，主要是因為甲狀腺發炎所致。在亞急性甲狀腺炎的初期，還會有一定的甲狀腺機能亢進，患者需要積極配合醫生進行治療。