龜頭流水流膿腫痛可能是龜頭炎或尿道炎引起的。龜頭炎常常由金黃色葡萄球菌等革蘭氏陽性球菌引起，這種細菌容易導致化膿。尿道炎則可能是淋菌性尿道炎，也是一種性傳播疾病。在癥狀上，龜頭炎可能伴有局部紅腫和疼痛，龜頭腫脹和流膿；尿道炎可能伴有尿頻、尿急、尿痛等癥狀，以及尿道口腫脹。
在治療上，龜頭炎可以使用碘伏或稀釋的高錳酸鉀溶液清洗、消毒，外用紅霉素軟膏，并配合藥物治療；尿道炎則一般以抗感染治療為主，使用頭孢克肟、鹽酸左氧氟沙星、硫酸依替米星、阿奇霉素等藥物。同時，在治療期間需要注意局部衛生，勤換洗內褲，避免辛辣刺激飲食，避免飲酒，適當多飲水，避免憋尿，有利于炎癥恢復。