您好！兩側睪丸出現輕微疼痛可能是由多種原因引起的。常見的原因包括睪丸炎、附睪炎、前列腺炎、精索靜脈曲張等。
首先，睪丸炎是較為常見的情況，通常由細菌或病毒感染引起，可導致局部腫脹、疼痛，并可能伴隨發熱等癥狀。建議及時到醫院進行檢查。
對于掛號科室的選擇，您應該掛普外科或者泌尿外科，這兩個科室都能處理相關問題。
至于費用方面，具體的檢查和治療費用會根據病情的嚴重程度、所需檢查項目以及治療方法的不同而有所差異。一般初步檢查可能在幾百元左右，但具體費用建議到醫院詳細咨詢。
此外，建議您盡快就診，避免延誤病情。希望我的回答對您有所幫助！