瑪卡具有降血脂、抗疲勞、提高免疫力的功效與作用，但服用后可能會產生過敏、激素水平變化、甲狀腺腫大的副作用。
瑪卡富含亞油酸，有利于清除體內血清膽固醇，起到降血脂的作用；瑪卡富含蛋白質、鐵元素、氨基酸等，有利于改善疲勞，提高機體免疫力?，斂ㄒ簿哂懈弊饔?，如果患者對瑪卡成分過敏，可能會引起皮膚瘙癢、紅腫、皮疹、腹瀉、嘔吐等過敏反應；同時，患者尤其是青春期患者服用瑪卡后，可能會引起體內激素水平變化；此外，瑪卡可能會造成人體碘代謝異常，可能會引起甲狀腺腫大。需注意嬰幼兒、孕婦、哺乳期婦女、甲狀腺疾病患者不建議服用瑪卡。
建議患者在醫生指導下使用瑪卡，不可自行用藥，以免引發不良后果。