通常情況下，發霉的瓜子含有黃曲霉素較多。黃曲霉素屬于有毒以及有害物質，過量攝入的情況下，會對身體健康造成較大的危害，具體情況分析如下。
瓜子在保存不當的情況下有可能會導致發霉，發霉后瓜子可能會滋生較多的細菌、黃曲霉菌等病原微生物，而黃曲霉素通常是由黃曲霉菌分泌而來，因此發霉的瓜子會含有較多的黃曲霉素。隨著瓜子發霉的程度加深，其中的黃曲霉素含量可能會越來越高。黃曲霉菌進入人體后，可能會導致急性胃腸炎、食物中毒等情況，引起惡心、嘔吐、腹痛、食欲不振、消化不良、大便次數增多等不適癥狀。同時黃曲霉菌屬于一種強致癌物質，若長時間或大量攝入，可能會增加致癌風險。
發霉的瓜子經過高溫的炒和煮都不能達到完全殺滅黃曲霉菌的效果，因此發霉的瓜子不建議再食用。同時還需要注意的是，沒有長霉的瓜子也不建議過量攝入，在過量攝入的情況下，由于瓜子熱量較高，長期攝入太多可能會增加肥胖的風險。