上火喉嚨痛可能是細菌感染，也可能是病毒感染引起，還可能是混合感染或其他疾病引起。患者應該及時到正規的醫院的呼吸內科做血常規等檢查，通過癥狀及實驗室檢查等進行分析，通常能夠明確是哪一種原因所導致，再針對性進行治療。
1、細菌感染：細菌侵襲機體，可能會引起上呼吸道感染或者咽炎、急性化膿性扁桃體炎，大多數是在上呼吸道感染之后，繼發細菌感染，有的甚至是厭氧菌感染，炎癥刺激會導致上火喉嚨痛的情況，而且還會伴有咳嗽、咳痰。如果患者血常規檢查中顯示白細胞明顯增高，合并中性粒細胞增高，考慮細菌感染可能大，可以遵醫囑給予抗生素類藥物進行治療，比如阿莫西林、頭孢呋辛酯、阿奇霉素等。
2、病毒感染：病毒感染也有可能會導致上呼吸道出現炎癥，比如皰疹性咽峽炎，主要是由柯薩奇病毒A組和新型腸道病毒71型引起的上呼吸道感染，一般起病急驟，突起高熱、咽痛、吞咽受累，患者可伴有食欲缺乏、乏力，少數有嘔吐、腹痛、頭痛等。檢查可見咽部充血，咽門、軟腭、腭垂等處散在灰白色皰疹，也可引起上火喉嚨痛癥狀。另外，如鼻病毒、腺病毒、流感病毒以及副流感病毒等侵襲上呼吸道時，可能會引起急性病毒性的咽喉炎。一般血常規檢查時會發現白細胞和中性粒細胞不會增高，淋巴細胞會偏高、偏低或者是正常，需要進行抗病毒治療，一般可在醫生指導下用阿昔洛韋、更昔洛韋、磷酸奧司他韋等藥物。
3、混合感染：例如扁桃體周圍膿腫、咽喉炎等，也可能是病毒和細菌混合感染導致，通常比較嚴重，需要遵醫囑使用頭孢曲松鈉、阿莫西林、阿昔洛韋等藥物治療。
4、其他疾病：如果日常長時間用嗓或大聲喊叫，不注意保護嗓子也會引起相關癥狀。另外，急性心肌梗死可能引起牽涉痛，反流性食管炎由于胃酸反流刺激咽喉部，也可能引起疼痛，可能會被誤認為上火喉嚨痛，通常需要進行心電圖、消化道鋇餐、胃鏡檢查等幫助明確。
出現上火喉嚨痛的情況時，需要明確診斷后及時遵醫囑治療，治療期間要注意飲食以清淡為主，避免吃辛辣、刺激性的食物，如辣椒、火鍋、芥末等，保護嗓子，以免導致上火喉嚨痛的癥狀加重。