這里所說的清腸一般是指在做腸鏡前進行清腸的準備。清腸出現黃水，多考慮應該是腸道仍舊沒有清潔干凈，可以遵醫囑繼續增加清腸藥量，直至大便變清，排泄出清水就可以了。
做腸鏡前需要做清腸的準備，如果排泄物有黃色糞便會在醫生做腸鏡的時候影響對腸黏膜情況的觀察，就可能會影響檢查結果。通常服用復方乙二醇電解質散、硫酸鎂與甘露醇，同時要配合適當的運動，這樣能促進排便，幫助清腸。
如果腸道內仍舊還有黃色糞便說明沒有清潔干凈，也可以考慮進行灌腸，達到將腸道清潔干凈的目的；但如果只是拉出黃水，排泄物也不帶糞渣，也有可能是膽汁影響的，可以及時跟檢查醫師溝通，看是否需要繼續服藥。
因此，在做腸鏡清腸前，最好以清淡食物為主，盡量不吃綠葉蔬菜或帶皮的西紅柿、海帶等。同時也要配合好醫生，做好腸鏡檢查前的清腸準備工作。