FMRI和MRI分別是指功能性磁共振成像和磁共振成像，兩種檢查的區別主要為檢查目的、成像內容不同、檢查部位不同等，建議到正規醫院進行檢查。
1、檢查目的：功能性磁共振成像和磁共振成像都屬于影像學檢查，但兩者檢查目的會有差異。其中功能性磁共振成像主要適用于評估代謝過程，而磁共振成像主要是提供人體內部結構圖片。
2、成像內容不同：上述檢查通常都屬于影像學檢查，但由于檢查目的影響，其成像內容會有差異。其中功能性磁共振成像是通過提供平均而得的腦部解剖影像，顯示出受外界刺激時的腦部活化區域，屬于實時觀測。而磁共振成像則屬于靜態成像。
3、檢查部位不同：功能性磁共振成像包含在磁共振成像中，其主要檢查部位也存在不同。功能性磁共振成像主要是檢查腦部血管、脊髓等部位。而磁共振成像的檢查范圍較廣，可用于全身各個部位。
除此之外，上述檢查的檢查范圍、價格會有不同。作為臨床上的檢查，通常建議到正規醫院進行上述檢查，可幫助降低誤診概率，保護患者的身體健康。